Cette thèse traite de la gestion et de la circulation des résidus organiques en Pays de la Loire. Elle s’inscrit dans le contexte réglementaire de la mise en œuvre du tri à la source des biodéchets (déchets alimentaires et verts) et de l’émergence de la notion de « bioéconomie circulaire » au sein de la région. Réalisée au sein du Conseil régional des Pays de la Loire et de l'AC3A (Association des Chambres d’Agriculture de l’Arc Atlantique), la recherche interroge les reconfigurations des filières de résidus organiques (apports-compostage, collecte-méthanisation, etc.).S'appuyant sur le concept de métabolisme territorial, elle propose une approche mixte issue des champs de la political ecology et de l'écologie territoriale. Ce cadre théorique et méthodologique permet de souligner l'importance d'analyser non seulement les flux de matières et d'énergie, mais aussi les systèmes de prise de décision, les relations de pouvoir entre acteurs sociaux et les pratiques agricoles.L'analyse se focalise sur trois terrains d'études (agricole, agro-industriel et touristique) aux dynamiques et profils métaboliques spécifiques, au-delà de l'échelle des pays, des régions et des grandes villes. Ces territoires ont des logiques singulières d’hybridation des filières et de marchandisation des matières organiques. Les résultats révèlent les conséquences des politiques publiques qui amènent la (dé)structuration, la concurrence ou la complémentarité de filières à différentes échelles.La thèse montre également comment des pratiques agricoles permettent des circularités en dehors des circuits marchands, à même de véritablement dématérialiser et boucler les flux de biomasses. Enfin, elle interroge l'approche du métabolisme territorial comme outil d’action publique environnementale capable d'orienter les systèmes sociotechniques

This thesis deals with the management and circulation of organic waste in the Pays de la Loire region. It fits into the regulatory context of the implementation of source separation of bio-waste (food and green waste) and the emergence of the concept of the ‘circular bioeconomy’ within the region. Conducted within the Pays de la Loire Regional Council and the AC3A (Association of Chambersof Agriculture of the Atlantic Arc), the research examines the reconfiguration of organic waste sectors (input-composting, collection-methanisation, etc.).Based on the concept of territorial metabolism, it proposes a mixed approach drawn from the fields of political ecology and territorial ecology. This theoretical and methodological framework highlights the importance of analysing not only material and energy flows, but also decision-making systems, power relations between social actors and agricultural practices.The analysis focuses on three areas of study (agricultural, agro-industrial and tourism) with specific dynamics and metabolic profiles, beyond the scale of countries, regions and large cities. These territories have unique approaches to hybridisation of sectors and commodification of organic materials. The results reveal the consequences of public policies that lead to the (de)structuring, competition or complementarity of sectors at different scales.The thesis also shows how agricultural practices enable circularity outside commercial circuits, capable of truly dematerialising and closing biomass flows. Finally, it questions the approach to territorial metabolism as a tool for public environmental action capable of guiding sociotechnical systems.